Автоматизированное рабочее место врача:  управление и информатика комплекса МЕКОС-Ц2

Управляющая платформа

Виртуальные слайды

Режимы съемки и типы виртуальных слайдов

Форматы виртуальных слайдов

Анализ виртуальных слайдов

Интеграция с локальной информационной сетью

SDK

Управляющая платформа МЕКОС-УП

Программа УПРАВЛЯЮЩАЯ ПЛАТФОРМА (МЕКОС-УП) входит в состав любой комплектации МЕКОС-Ц2. Она предоставляет универсальные автоматические функции микроскопии и универсальные управляющие и информационные средства. МЕКОС-УП позволяет  полностью или частично переместить процесс микроскопии на экран компьютера, создать единую комфортабельную эргономику и использовать все многообразие комплектаций оборудования.  

Средства МЕКОС-УП:

- диалоговая идентификация препарата, лаборанта, условий микроскопии ^Р)^А)^К);

- автоматическая идентификация препарата и лаборанта по штрих-коду^С);

- контроль качества условий наблюдения ^Р)^А);

- перемещение и фокусировка препарата по командам через клавиатуру или джойстик ^А);

-  автофокус ^А);

-  мультифокус ^Р)^А);

- отображение маршрута просмотра препарата, формирование стандартных маршрутов просмотра, повторное перемещение препарата в фиксированные точки маршрута^А);

- цифровая съемка поля зрения (микрофотография и видео) ^Р)^А);  

- диалоговая фиксация галереи препарата с полями зрения или фрагментами полей зрения ^Р)^А);

- база данных (галереи, атласы, видео, запросы, импорт, экспорт, редакция, печать, защита) ^Р)^А)^К);

- интернет сопровождение изготовителя ^Р)^А)^К);

- тесты и средства настройки оборудования ^А).

^Р) средство для работы в составе немоторизованной комплектации МЕКОС-Ц2;

^А) средство для работы в составе моторизованной комплектации МЕКОС-Ц2;

^К) средство для работы на компьютере с виртуальным слайдом;

^С) средство для работы в составе комплектации с опцией сканер штрих-кода.

Автоматические автофокус и мультифокус, автоматический контроль качества условий съемки улучшают условия визуального анализа. Средства формирования маршрутов полного скрининга, контроля полноты просмотра и возврата в заданные точки увеличивают эффективность поиска редких объектов, в частности, в гинекологии и паразитологии.

Виртуальные слайды

Виртуальный слайд (ВС) является цифровой копией области препарата, многократно превышающей размеры поля зрения микроскопа. Технология изготовления ВС сохраняет информацию на стыках полей зрения, обеспечивая непрерывную панораму. ВС может быть просмотрен на компьютере без микроскопа. Изготовление ВС осуществляется в автоматическом режиме на автоматизированных комплексах микроскопии, таких как МЕКОС-Ц2. ВС  может использоваться для телемедицинских консультаций, контроля качества анализов, обучения персонала, создания компьютерного архива ценных препаратов. Качество изображения в ВС определяется качеством оптики, электромеханических компонент, видеокамеры и программного обеспечения комплекса микроскопии, выполняющего съемку ВС.

По сравнению с группой полей зрения препарата, зафиксированных вручную оператором в базе данных компьютерного немоторизованного микроскопа, ВС является гораздо более точной, представительной и объективной моделью препарата, пригодной для многократного применения в различных целях. Благодаря средствам навигации и выбора увеличения, аналогичным широко известным средствам просмотра карт в Интернет, специальным эффектам просмотра 3-х мерного ВС, может быть значительно ускорен поиск анализируемых объектов по сравнению с прямой микроскопией натурального препарата. Благодаря современным информационным технологиям ВС обладает мобильностью, позволяющей радикально увеличить возможности пересылки и дистанционного анализа. Благодаря высокой скорости изготовления ВС может обладать повышенной информативностью по сравнению со скоропортящимся или повреждаемым натуральным препаратом.

Программа МЕКОС-ВИС для производства виртуальных слайдов  

1. Режимы съемки и типы ВС

 C помощью МЕКОС-ВИС возможно изготовление 3-х типов ВС: 2-х мерных (2DVS) для тонких (по сравнению с глубиной фокуса объектива) статических препаратов, 3-х мерных (3DVS) для толстых  статических препаратов и динамических (DyVS) для толстых препаратов с перемещающимися в поле зрения объектами анализа.  При изготовлении 2DVS осуществляется автоматическая фокусировка поля зрения. При изготовлении 3DVS фиксируются поля зрения с послойным перемещением фокуса на глубину резкости объектива. Горизонтальное перемещение препарата и совмещение соседних кадров при изготовлении 2DVS и 3DVS выполняются таким образом, чтобы не была потеряна информация на стыках. Съемка препарата осуществляется на заданном максимальном увеличении, просмотр может быть осуществлен на этом увеличении или на программно формируемом меньшем увеличении. 2DVS и 3DVS выглядят на экране компьютера как сплошная панорама, аналогично тому, как выглядит препарат в окулярах микроскопа. Просмотр аналогичен микроскопии оригинального препарата с имитацией смены условий съемки включая смену объективов и конденсоров, перемещения поля зрения.  Каждое поле зрения 3DVS на экране компьютера можно просматривать, перемещая фокус как при обычной микроскопии. Может быть задан режим автоматического выбора для начала просмотра наиболее контрастного слоя Z. Такой режим визуального анализа 3DVS во многих случаях (моча, фекалии, мокрота и др.) позволяет более быстро и тщательно просматривать препарат, чем при непосредственной микроскопии натурального препарата.  Предоставляется также функция мультифокуса, когда на экране из каждого слоя будет автоматически представлена только сфокусированная часть объекта. В последнем случае весь толстый объект на экране будет в фокусе, что неосуществимо при обычной микроскопии. Для препаратов с динамическими объектами (н-р, живые сперматозоиды), может осуществляться съемка поля зрения в течение заданного времени с формированием и просмотром DyVS в стандартных форматах цифрового фильма. Съемка ВС на больших увеличениях (100х) предъявляет повышенные требования к оптике и электромеханическим компонентам микроскопа.

МЕКОС-ВИС входит во все пакеты специализированных моторизованных комплектаций МЕКОС-Ц2.  Семейство МЕКОС-Ц2 располагает также универсальными моделями, предназначенными для производства  виртуальных слайдов.

Основная проблема применения ВС - его значительный объем, который при большой площади сканирования, большом увеличении и большом разрешении видеокамеры может достигать нескольких гигабайт. Чтобы уменьшить размер ВС, можно использовать средства МЕКОС-ВИС по рациональному размещению зон сканирования в площади препарата. Для этого МЕКОС-ВИС предлагает выполнить предварительный просмотр препарата на малом увеличении. Оператор при этом указывает на экране компьютера поля зрения, которые войдут в состав области сканирования при формировании ВС на заданном максимальном увеличении. МЕКОС-ВИС информирует о текущем накопленном объеме будущего ВС.  В результате определяются относительно небольшие прямоугольные зоны сканирования препарата для будущего ВС, которых может быть несколько по всей площади препарата. Последующее формирование ВС по указаниям предварительного просмотра осуществляется в МЕКОС-ВИС автоматически.

2.Форматы ВС  

Программа МЕКОС-ВИС позволяет формировать ВС в формате с персональными данными пациента и в формате без персональных данных. В первом случае применяется стандарт DICOM 3х, во втором случае кроме DICOM могут быть выбраны форматы МЕКОС-ВС и Google-map. В последнем случае для просмотра ВС используются средства известных Интернет браузеров. Просмотр и работа с ВС в форматах DICOM и МЕКОС-ВС осуществляется с использованием программы МЕКОС-ВИМ. ВС с персональными данными могут экспортироваться только в защищенную информационную систему персональных данных (ИСПДн), имеющую соответствующие сертификаты.  ВС без персональных данных автоматически снабжается случайным анонимным идентификатором. Анонимный ВС может быть экспортирован в открытую сеть, включая Интернет.

Программа анализа виртуального слайда МЕКОС-ВИМ

Просмотр и работа с ВС в форматах DICOM и МЕКОС-ВС осуществляется с использованием программы МЕКОС-ВИМ. МЕКОС-ВИМ может работать на компьютере из состава МЕКОС-Ц2 или на отдельном компьютере. ВС может быть взят из базы данных МЕКОС-Ц2 или импортирован на носителе или по линиям связи.  При применении ВС стандарта DICOM программа МЕКОС-ВИМ отображает персональные данные, в этом случае она должна работать в составе защищенной ИСПДн. При использовании анонимного ВС отображается его код идентификации.

Программа МЕКОС-ВИМ может быть вызвана из любой функциональной программы анализа МЕКОС-Ц2 для имитации ввода изображения препарата, представленного соответствующим ВС. Сформированный с помощью МЕКОС-ВИС виртуальный слайд может быть дополнен в МЕКОС-ВИМ комментариями эксперта в графической и текстовой форме. Комментарии, обычно занимающие небольшой объем по сравнению с ВС, могут быть представлены в отдельном файле и пересланы отдельно от ВС. Полученная таким образом "референсная модель препарата" может быть просмотрена на фоне ВС с применением МЕКОС-ВИМ.